税務相互相談会の皆様

いつもお世話になっております。
消費税・インボイス関係の過去の質問を探してみたのですが、
みつけられず、また、些細な話で恐縮ですが､よろしくお願いいたします。

【税目】消費税

【対象顧客】
適格請求書発行事業者（法人・個人）

【前提１】
・R5.10.1より適格請求書発行事業者。
9.30以前も課税事業者です。
適格請求書発行時の消費税の計算・端数処理の計算について

【前提２】
登録番号未記載の請求書を受け取った場合

【質問】
１）適格請求書を発行する際、取引先によって、
税抜金額をもとに消費税額を計算する場合と、
税込金額をもとに消費税額を計算する場合が生じそうです。
取引先相手によって､作成方法が、異なってしまうことは、
問題になりますか？
（どちらかに統一する必要はありますか？）
（実務的に、相手の要求に合わせざるを得ない部分があるようです）

２）適格請求書を発行する際、取引先によって、
端数処理の計算方法が異なってもかまいませんか？
統一しないといけないでしょうか？
（※相手方が仕入税額控除する際、積上げ計算に使用する税額が異なるだけで、
影響ないのかな…と漠然と考えています）
また、当社は、税込入力(月末税抜)・割戻し計算・端数処理切捨てで申告書
を作成する予定ですが、問題がありますでしょうか。

３）※【前提２】受け取った請求書について
１）．２）とは逆に、受け取った側の話も質問させてください。
受け取った請求書に登録番号の記載がない場合、請求書発行者が法人であれば、
法人番号検索→登録番号検索と、適格請求書発行事業者であるかどうかの確認
を取ることが可能かと思いますが、
この方法によって確認した場合には、登録番号検索サイトの情報を印刷するなどして残しておけば、
請求書発行者側に、登録番号の問い合わせをしなくてもよろしいでしょうか？
それとも、調べたうえで、登録番号未記入のため、
請求書の再発行なり、
登録番号の通知文書なりを先方から改めて受領する必要がありますか？


【参考】
p45－
https://www.nta.go.jp/taxes/shiraberu/zeimokubetsu/shohi/keigenzeiritsu/pdf/0022009-090.pdf#page=45

以上です。よろしくお願いいたします。