久保さん

下記について教えて下さい。

【前　　提】

久保さん
いつもお世話になってます。

１年近くかかり、ようやく先日法人調査が終了しました。
論点は、社長個人口座への得意先からの
振込金(コンサル代とのこと)についてでした。
個人に帰属するのか法人に帰属するのかは微妙なところです。

社長個人は給与＋事業所得として確定申告していますが、
その金額分は申告もれ(聞いていない！)です。

最終的に法人への売上計上もれ・社長貸付金で話がまとまとまりました。
しかしその後、法人に帰属する確証が得られなかったためなのかは不明ですが、
審理に差し戻されたらしく、その入金分はあくまでの個人の収入として
所轄税務署へ連絡するとのことです。
法人については、他論点で一部修正申告となりました(増差税額なし)。

【質　　問】

社長個人には自主的修正申告するよう指導予定ですが･･･
・所轄税務署の個人課税部門への連絡はどのような方法で行くことになりますか。
・連絡を受けた個人課税部門ではどのような判断基準となりますでしょうか。
・申告もれ金額は約900万ほどと大きいです。

【添付資料】

特になし