この度、Ａ法人に4月、税務調査が決定した法人があります。

業務委託手数料として金額の大きな取引が存在しているので、
業務委託契約書の確認を迫ったところ、「実は・・・」と切り出されて、
もともとＡ法人はＢ法人の出資が50％入っており、
数年前にＢ法人よりＡ法人の代表者へ
株式譲渡を行っていた経緯がありました。

その際、株式譲渡代金の一括清算が難しかったようで、
分割で支払う約束をしていたようです。

その分割代金を業務委託手数料として
損金経理していたようです。

上記の事実関係から、
調査前に修正申告をするか否か
Ａ法人の代表者と話を詰めておりました。

金額から考えても調査の争点となる確率は高いと感じており、
この場合事前の修正申告によって
重加算、役員賞与金まで発展する
可能性があると思われるでしょうか？

よろしくお願いいたします。